Использование метода времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-ToF MS) для индикации и идентификации возбудителей I - II групп патогенности
Использование метода времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-ToF MS) для индикации и идентификации возбудителей I - II групп патогенности
Дата добавления в базу:
12.02.2016
Дата актуализации:
01.01.2021
Дата введения:
24.04.2014
Область применения:
Методические рекомендации предназначены для специалистов лабораторий, осуществляющих диагностические, мониторинговые и научные исследования с возбудителями опасных инфекционных болезней. Методические рекомендации по использованию метода масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией для идентификации возбудителей чумы, холеры и туляремии включают описание применения масс-спектрометрии для видовой идентификации микроорганизмов - возбудителей опасных инфекционных заболеваний. Описание охватывает такие разделы, как культивирование исследуемых штаммов, получение из них белковых препаратов, снятие спектров, дополнение базы данных референсных спектров, проведение идентификации с использованием расширенной базы данных, интерпретацию полученных результатов, приводится список используемых реактивов и расходных материалов.
Оглавление:
1. Область применения 2. Общие положения 3. Требования к организации работ 4. Культивирование микроорганизмов 4.1. Культивирование возбудителя чумы 4.2. Культивирование возбудителя холеры 4.3. Культивирование возбудителя туляремии 4.4. Культивирование возбудителя сибирской язвы 5. Подготовка проб для масс-спектрометрии 5.1. Экстракция белков .с использованием муравьиной кислоты 5.2. Экстракция белков с использованием трифторуксусной кислоты 5.3. Прямое нанесение образцов на мишень 6. Проведение MALDI-ToF масс-спектрометрии 7. Учет и интерпретация результатов 8. Дополнение базы данных программ Приложение 1. Среды, используемые для культивирования возбудителей чумы, холеры, туляремии, сибирской язвы Приложение 2. Оборудование и программное обеспечение для проведения исследований методом MALDI-ToF масс-спектрометрии Приложение 3. Реактивы для проведения исследований методом MALDI-ToF масс-спектрометрии Приложение 4. Расходные материалы для проведения исследований методом MALDI-ToF масс-спектрометрии Приложение 5. Приготовление рабочих растворов для проведения исследований методом MALDI-ToF масс-спектрометрии Приложение 6. Очистка MALDI-чипа (мишени) Библиография
Разработан:
Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии ФКУЗ Российский научно-исследовательский противочумный институт Микроб ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока ФКУЗ Ростовский научно-исследовательский противочумный институт ФКУЗ Волгоградский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора
Утверждён:
24.04.2014 Главный государственный санитарный врач Российской Федерации
Издан:
Бюллетень нормативных и методических документов Госсанэпиднадзора (2015 г. (2 (60)))